В отделении действует Центр муковисцидоза, где в лечении и обследовании применяются современные методы согласно клиническим рекомендациям. В диагностике наследственных болезней обмена, других орфанных заболеваний используются современные молекулярно-генетические методы. Детям с болезнями обмена проводится непрерывный мониторинг глюкозы. Детям с сахарным диабетом 1 типа производится установка помпы под контролем системы суточного мониторирования глюкозы. В учреждении лечат ожирения у детей с использованием передовых технологий – аналога глюкагоноподобного пептида 1. Также проводится биологическая терапия бронхиальной астмы.